Mimo pierwotnego defektu sekrecji androgenów występującego u wszystkich pacjentek z zespołem PCO, u niektórych dominującym problemem nie jest nadmiar androgenów, ale insulinooporność.
Warto podkreślić, że celem postępowania terapeutycznego jest eliminowanie zgłaszanych objawów. W części przypadków może temu służyć połączenie antykoncepcji hormonalnej i antyandrogenów, w innych – lepszym rozwiązaniem jest metformina. Stosowanie antykoncepcji hormonalnej wydaje się nie zwiększać insulinooporności u pacjentek z PCOS.
Nową koncepcją terapeutyczną jest zastosowanie analogów GLP-1 (liraglutyd).